É normal que parte das notas fiscais emitidas dê algum erro que demande ajustes para depois submeter novamente. O sistema iNFSe tem mecanismos para facilitar isso e vamos demonstrar aqui.
Depois de mapear os campos no arquivo (Excel ou CSV) que tem os dados das notas a serem emitidas, você deve usar o botão "Submeter" para o processamento ser iniciado. Para evitar erros por limites no tempo de processamento, o sistema envia as notas fiscais em blocos. Por padrão, o bloco é de 20 notas por vez, mas você pode aumentar isso na seção de configurações:
Ao submeter, você pode então acompanhar o andamento de cada bloco enviado:
Na seção de projetos você pode consultar o resultado da emissão de notas fiscais de serviço em lote que realizar. Lá dá para baixar facilmente apenas os registros que não puderam ser emitidos.
Ao abrir o arquivo, você verá na última coluna a informação sobre o erro de emissão, podendo então fazer os ajustes e submeter como um novo projeto sem complicação, resolvendo o problema de forma pontual, apenas para os registros que deram erro.
Caso você tenha submetido a lista em teste e queira ajustar os registros que deram erro a partir da lista original, para depois de validar tudo submeter direto na produção a lista completa, pode descer até o final da página e usar o botão para baixar o arquivo original:
O interessante é que esse arquivo baixado terá no topo os registros que deram erro. Duas colunas serão adicionadas no final contendo informações sobre o erro, permitindo que você corrija e salve o arquivo completo para então poder submeter tudo de uma só vez novamente.